MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 37497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAT	2	6	86	91	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
2	NC_015636	ACAT	2	8	105	112	50 %	25 %	0 %	25 %	336121002
3	NC_015636	T	6	6	187	192	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
4	NC_015636	CAT	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
5	NC_015636	TGCCA	2	10	250	259	20 %	20 %	20 %	40 %	336121002
6	NC_015636	AT	4	8	274	281	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
7	NC_015636	CTT	3	9	327	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121002
8	NC_015636	ATT	2	6	376	381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
9	NC_015636	T	6	6	386	391	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
10	NC_015636	T	7	7	409	415	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
11	NC_015636	TGT	2	6	420	425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121002
12	NC_015636	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
13	NC_015636	T	6	6	473	478	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
14	NC_015636	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
15	NC_015636	AT	3	6	538	543	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
16	NC_015636	TAT	2	6	558	563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
17	NC_015636	ACA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121003
18	NC_015636	TA	3	6	724	729	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
19	NC_015636	AT	3	6	748	753	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
20	NC_015636	AT	3	6	755	760	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
21	NC_015636	AT	4	8	799	806	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
22	NC_015636	TTTA	2	8	810	817	25 %	75 %	0 %	0 %	336121003
23	NC_015636	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
24	NC_015636	TA	3	6	962	967	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
25	NC_015636	ATTA	2	8	985	992	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
26	NC_015636	TGTAT	2	10	1021	1030	20 %	60 %	20 %	0 %	336121003
27	NC_015636	CTT	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121003
28	NC_015636	A	6	6	1150	1155	100 %	0 %	0 %	0 %	336121003
29	NC_015636	TAT	2	6	1170	1175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
30	NC_015636	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
31	NC_015636	TGT	3	9	1212	1220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121003
32	NC_015636	A	7	7	1264	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	336121003
33	NC_015636	TAT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
34	NC_015636	GAA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
35	NC_015636	TAT	2	6	1431	1436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
36	NC_015636	A	8	8	1452	1459	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
37	NC_015636	TGAT	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	336121004
38	NC_015636	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
39	NC_015636	C	6	6	1513	1518	0 %	0 %	0 %	100 %	336121004
40	NC_015636	AGA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
41	NC_015636	ATAA	2	8	1572	1579	75 %	25 %	0 %	0 %	336121004
42	NC_015636	GAA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
43	NC_015636	TGA	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
44	NC_015636	ATATT	2	10	1625	1634	40 %	60 %	0 %	0 %	336121004
45	NC_015636	AT	3	6	1649	1654	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
46	NC_015636	ATA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
47	NC_015636	ATA	2	6	1666	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
48	NC_015636	ATTA	2	8	1733	1740	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
49	NC_015636	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
50	NC_015636	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
51	NC_015636	TA	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
52	NC_015636	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
53	NC_015636	ATT	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
54	NC_015636	CAT	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121004
55	NC_015636	A	6	6	1913	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
56	NC_015636	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
57	NC_015636	A	6	6	1934	1939	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
58	NC_015636	ACA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121004
59	NC_015636	AT	3	6	1969	1974	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
60	NC_015636	AGT	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
61	NC_015636	AGA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
62	NC_015636	ATTT	2	8	2068	2075	25 %	75 %	0 %	0 %	336121004
63	NC_015636	A	7	7	2130	2136	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
64	NC_015636	ACC	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336121004
65	NC_015636	A	7	7	2174	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
66	NC_015636	GAA	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
67	NC_015636	TTA	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
68	NC_015636	A	6	6	2247	2252	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
69	NC_015636	GTA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
70	NC_015636	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
71	NC_015636	TAAA	2	8	2431	2438	75 %	25 %	0 %	0 %	336121004
72	NC_015636	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
73	NC_015636	A	6	6	2544	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
74	NC_015636	TC	3	6	2601	2606	0 %	50 %	0 %	50 %	336121004
75	NC_015636	A	7	7	2616	2622	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
76	NC_015636	ATA	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
77	NC_015636	TAA	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
78	NC_015636	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
79	NC_015636	ATA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
80	NC_015636	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
81	NC_015636	GTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
82	NC_015636	ATG	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
83	NC_015636	A	6	6	2916	2921	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
84	NC_015636	ATT	2	6	2927	2932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
85	NC_015636	TGA	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
86	NC_015636	ATG	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
87	NC_015636	TAA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
88	NC_015636	ATG	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
89	NC_015636	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121004
90	NC_015636	TGA	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
91	NC_015636	TAA	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
92	NC_015636	A	6	6	3357	3362	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
93	NC_015636	A	7	7	3369	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
94	NC_015636	AAT	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
95	NC_015636	AGA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121005
96	NC_015636	AAT	3	9	3433	3441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
97	NC_015636	AAAC	2	8	3510	3517	75 %	0 %	0 %	25 %	336121005
98	NC_015636	ATA	2	6	3542	3547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
99	NC_015636	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
100	NC_015636	A	7	7	3595	3601	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
101	NC_015636	GA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	50 %	0 %	336121005
102	NC_015636	TAT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121005
103	NC_015636	TGA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121005
104	NC_015636	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
105	NC_015636	TAA	2	6	3707	3712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
106	NC_015636	ACAATA	2	12	3746	3757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121005
107	NC_015636	A	6	6	3785	3790	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
108	NC_015636	A	7	7	3874	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	336121006
109	NC_015636	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
110	NC_015636	AGA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
111	NC_015636	GAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
112	NC_015636	AT	3	6	3961	3966	50 %	50 %	0 %	0 %	336121006
113	NC_015636	CAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121006
114	NC_015636	CAT	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121006
115	NC_015636	CTG	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336121006
116	NC_015636	ATA	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
117	NC_015636	ATTGA	2	10	4159	4168	40 %	40 %	20 %	0 %	336121006
118	NC_015636	A	6	6	4170	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	336121006
119	NC_015636	GGT	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121006
120	NC_015636	AGT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
121	NC_015636	TAA	2	6	4268	4273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
122	NC_015636	TGA	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
123	NC_015636	AGA	2	6	4299	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
124	NC_015636	AAG	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
125	NC_015636	TAT	2	6	4366	4371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
126	NC_015636	CAAA	2	8	4409	4416	75 %	0 %	0 %	25 %	336121006
127	NC_015636	AATATA	2	12	4463	4474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
128	NC_015636	ATT	2	6	4496	4501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
129	NC_015636	GAAA	2	8	4503	4510	75 %	0 %	25 %	0 %	336121006
130	NC_015636	A	6	6	4508	4513	100 %	0 %	0 %	0 %	336121006
131	NC_015636	TAT	2	6	4543	4548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
132	NC_015636	TA	3	6	4577	4582	50 %	50 %	0 %	0 %	336121006
133	NC_015636	A	7	7	4593	4599	100 %	0 %	0 %	0 %	336121006
134	NC_015636	TAA	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
135	NC_015636	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
136	NC_015636	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336121006
137	NC_015636	AAT	2	6	4757	4762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
138	NC_015636	GAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
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275	NC_015636	A	7	7	9524	9530	100 %	0 %	0 %	0 %	336121012
276	NC_015636	ATT	2	6	9579	9584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121012
277	NC_015636	ACT	2	6	9587	9592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121012
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280	NC_015636	GTGG	2	8	9681	9688	0 %	25 %	75 %	0 %	336121012
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302	NC_015636	A	6	6	10818	10823	100 %	0 %	0 %	0 %	336121013
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307	NC_015636	ATT	2	6	11169	11174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121014
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386	NC_015636	TTCC	2	8	14364	14371	0 %	50 %	0 %	50 %	336121018
387	NC_015636	T	6	6	14396	14401	0 %	100 %	0 %	0 %	336121018
388	NC_015636	TCA	3	9	14426	14434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121018
389	NC_015636	GAT	2	6	14456	14461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121018
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391	NC_015636	CTT	2	6	14693	14698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121018
392	NC_015636	TTC	2	6	14848	14853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121018
393	NC_015636	TAGG	2	8	14872	14879	25 %	25 %	50 %	0 %	336121018
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395	NC_015636	ATC	2	6	14933	14938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121018
396	NC_015636	T	6	6	14939	14944	0 %	100 %	0 %	0 %	336121018
397	NC_015636	T	7	7	15003	15009	0 %	100 %	0 %	0 %	336121018
398	NC_015636	T	6	6	15062	15067	0 %	100 %	0 %	0 %	336121018
399	NC_015636	AT	4	8	15376	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
400	NC_015636	GTT	2	6	15384	15389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121019
401	NC_015636	A	7	7	15403	15409	100 %	0 %	0 %	0 %	336121019
402	NC_015636	AG	3	6	15433	15438	50 %	0 %	50 %	0 %	336121019
403	NC_015636	AATCAA	2	12	15491	15502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121019
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405	NC_015636	AGA	2	6	15510	15515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121019
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